درختان پسته نسبت به سرمای دیررس بهاره بسیار حساس می‌باشند. خطر سرمازدگی در ارقام زود رس مانند کله قوچی زیادتر است و دلیل آن هم به علت رشد سریع و رویش زودتر درختان کله قوچی است. میزان خسارت سرمازدگی در سال‌های مختلف متفاوت است و گاها به ۱۰۰ درصد محصول نیز رسیده است اما به صورت متوسط خسارت سرمازدگی ۳۰-۲۵ درصد برآورد می‌شود.
افلاتوکسین‌ها سموم قارچی هستند که می‌توانند در محصولات کشاورزی مانند پسته تولید شوند و خطرات جدی برای سلامت انسان ایجاد کنند. این سموم عمدتاً توسط
علائم این بیماری توسط گروهی از قارچ‌ها از جنس Alternaria alternata (آلترناریا ) ایجاد می‌شود. آن‌ها در خاک یا بر روی بقایای گیاهان به خواب
بیماری ورتیسیلیومی پسته توسط قارچ ورتیسیلیوم (Verticillium Wilt) ایجاد می‌شود. ورتیسیلیوم قارچی در انواع خاک‌ها مشاهده می‌شود. قارچ ورتیسیلیومی دارای دامنه میزبانی وسیع بوده و
گال‌ها یکی از انواع مهم آفات درخت پسته هستند که باکتریایی بوده و در نقاط مختلف ساقه و ریشه درخت رشد می‌کنند. گال‌ها در ابتدا
این ارگانیسم فاقد اسپور، بدون دیواره سلولی و غیر متحرک، به شکل کروی یا رشته‌ای است که شکل رشته‌ای آن در اوایل فصل در مراحل
این بیماری فقط به مغز دانه‌ی پسته خسارت میزند و باعث فساد مغز پسته می‌شود. عامل ماسوی پسته قارچ Nematospora coryli است. پرگنه‌ی قارچ در
عامل بیماری قارچ است. قارچ کنیدیوم‌هایی به رنگ بژ روشن، لیمویی شکل و صاف تولید می‌کند. سختینه‌هایی که روی شاخه‌های آلوده سال قبل تشکیل می‌شوند
این بیماری قارچ ریشه بلوط نیز نامیده می‌شود که توسط یک قارچ خاکزاد عسلی به نام Armillaria mellea ایجاد می‌شود و عامل بیماری بسیاری از
شدت تابش نور خورشید و افزایش دما بیشتر از حد تحمل گیاه در زمان رشد سریع مغز سبب ایجاد عارضه آفتاب سوختگی روی میوه می‌گردد.
اختلاف بیش از حد و غیر طبیعی درجه حرارت در طول شب و روز از رشد گیاه را نوسانات دمایی گویند که باعث ایجاد عوارض